ジョン・モークリーは、世界初のコンピュータＥＮＩＡＣの開発者である。だが、その名誉はフォン・ノイマンに奪われてしまった。モークリーらが決定したコンピュータの設計方式を、あとから開発に参加したノイマンが、かってに自分の名前で発表してしまったためである。このため、現在のコンピュータは、「モークリー方式」とは呼ばれず、「ノイマン方式」と呼ばれている。
　名を失っても、せめて実を取ろうと、モークリーはＥＮＩＡＣの改良型であるエドバックの特許取得をめざした。だが、これもノイマンの妨害にあって果たせなかった。「アメリカの頭脳」と呼ばれるノイマンに、軍と政府が味方したためといわれる。
　やむなくモークリーは、ＥＮＩＡＣの特許を取得することにしたが、そのために大学をクビになってしまった。ＥＮＩＡＣの特許権を譲るよう強要した大学側と、争いになったためである。ＥＮＩＡＣの特許が交付されたのは、申請から１７年後のことである。
　さらに晩年には、ＥＮＩＡＣの特許をめぐる裁判に負け、「モークリーは他人の発明を盗んだ」と言われるようになる。モークリーはＥＮＩＡＣの開発以前に、アイオワ州立大学のアタナソフ教授が作った電子計算機（ＡＢＣマシン）を見学したことがあった。これが「発明剽窃」と認定されたのである。
　しかし、当のアタナソフ自身、ＥＮＩＡＣがＡＢＣマシンの原理を受け継いだものだとは考えていなかった。そもそもＡＢＣマシンは、設計が未熟なため、完成することなく消えたマシンだった。それでも多くの人が、「世界初のコンピュータはＡＢＣマシンで、ＥＮＩＡＣはその盗作だった」と信じることとなった。モークリーは汚名に悲憤しながら一生を終えた。